國家十一五期間要加大衛生投資力度，這將有利于醫療保障的普及，惠及更廣大的人群。但是，從社會總收益考慮，衛生資源支付力度必定是有限的，有限的資源必須以最佳的方式來使用。因此，政府應該在這一領域開展藥物經濟學研究，尤其是直觀易懂的成本效益分析知識應該在醫療、醫保從業人群中進行普及。
　　
藥物經濟學不僅關注藥物治療的效果，同時也關注藥物的治療成本，鑒于藥物經濟學在制定《國家基本藥物目錄》、作為制定衛生保健制度和公費醫療保健制度的可靠參考依據、幫助臨床醫生和藥師選擇最佳治療方案、藥品研發和流通經濟學評估等方面的作用，目前藥物經濟學已被眾多國家用于控制藥品費用的各個領域，這些領域涉及衛生政策的制定、醫療保險、醫學理論研究、醫學臨床和藥物研發。

我國在藥物經濟學領域的研究深度和廣度遠遠不夠，不僅與國際水平相距甚遠，僅就國內理論研究水平而言，也遠遠不能滿足實際應用的需求。
　　
從醫療保險這方面來看，藥物經濟學對于醫保決策、醫保管理、醫保經營和醫保人群都具有實用意義。首先，藥物經濟學可以用于制定醫保用藥報銷范圍。目前我國的《國家基本藥物目錄》主要考慮藥物的安全性和有效性，對經濟因素、價格因素考慮較少。醫保用藥報銷范圍雖然考慮了臨床需要和經濟等綜合因素，但其經濟因素主要指藥物的療程價格，沒有考慮藥物治療過程中的其他費用（如檢查化驗費、住院費等），因而存在著一定的缺陷。其次，藥物經濟學是醫院制定醫院用藥目錄、規范醫生用藥的科學依據。藥物經濟學的研究結果有助于醫院將那些成本效果好的藥物選進醫院用藥目錄。第三，藥物經濟學可以幫助病人正確選擇藥物。隨著人群的自我保健意識的逐步增強，病人對有關藥品信息的需求將會增加，尤其是藥品的價格、效果和成本，藥物經濟學研究可滿足病人這方面的需求。綜上，用藥物經濟學的鏈條將政策制定、醫保管理、醫保經營和醫保人群鏈接起來，建立第三方評估體系，通過政策調整，使有限的衛生資源被更廣大的人群分享，全社會醫療保障的覆蓋面將會進一步加大。