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人類免疫缺陷病毒-1的核酸遺傳學特點

【?2006-09-15 發布?】 臨床報道  

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    (深圳)為了研究人類免疫缺陷病毒(HIV)-1膜蛋白基因(env)的準種與變異特點。研究者采用套式聚合酶鏈反應(PCR)對5例艾滋病患者血漿HIV-1 env基因C2~V3區進行PCR擴增,產物經純化后克隆至pMD-18T載體中,每例患者分別挑取5~8個克隆,共34株,完成陽性克隆的鑒定、抽提純化和測序,將獲得的DNA序列及核苷酸序列進行分析,并計算其核苷酸同源替換率(ds)與非同源替換率(dn)的比值。結果同一患者體內HIV準種株平均為83.5%,各克隆株之間的核苷酸同源性在88%~99%之間;不同患者之間的核苷酸同源性在75%~91%;34株序列的V3區平均變異頻率明顯高于C2~C3區(P<0.05);而V3區和C2~C3區的ds/dn比值均>1。可見艾滋病患者體內有大量HIV準種存在,基因的變異在V3區發生較頻繁,免疫選擇壓力在該區變異中不起主要作用。/**/
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